RFID标签的工作频率是其最重要的特点之一。工作在不同频段或频点上的标签具有不同的特点。射频识别应用占据的频段或频点在国际上有公认的划分，即位于ISM波段之中。典型的工作频率有：125kHz，133kHz，13.56MHz，27.12MHz，433MHz，902~928MHz，2.45GHz，5.8GHz等。
一、低频标签
低频段电子标签，简称低频标签，频率范围一般是30KHz~300KHz。在实际应用中，最典型的应用频率有125kHz、133kHz。低频标签通过电感耦合的方式进行能量供应和数据传输，一般是无源标签。与低频标签相关的国际标准有：ISO11784/11785、ISO18000-2。
低频标签的优势在于：标签芯片一般采用普通的CMOS工艺，不仅省电而且廉价，性价比较高；其工作频率受温湿度及障碍物等外部环境的影响小，可以有效的穿透水、木材有机组织等，适应恶劣的工作环境；同时因其自身特性，低频标签十分适合低速、近距离、对数据量要求不高的识别工作。反之，低频标签的自身特性也限制了它的应用。比如：低频标签识别距离短，只能在近距离、低速的识别中应用；低频标签数据存储量少，传输速度慢，灵活性差，安全性差，易被破解；与其他频段的标签相比，低频标签天线匝数更多，提高了成本。
低频标签主要应用在动物识别、容器识别、物品追踪、电子闭锁防盗（带有内置应答器的汽车钥匙）等。一般动物识别的应用案例有很多，外观形式也有项圈式、耳标式、药丸式等众多种类，不尽相同。典型应用于畜牧业，例如猪、羊、牛、马等。
二、高频标签
高频标签的频率防伪一般为3MHz ~ 30MHz，在实际应用中典型的应用频率有13.56MHz。高频标签工作能量的获取方式与低频标签相同，一般也采用无源方式。这类标签技术与应用相对来讲十分成熟，由于工作频率相比低频标签有提高，因而具备较快的读写速度和传输熟虑。协议一般是：相关的国际标准有：ISO14443、ISO15693、ISO18000-3（13.56MHz）等。