控制单元的主要功能：与上层应用软件进行通信，并执行应用软件发来的命令;控制与电子标签的通信过程;信号的编码与解码。对于某些特定系统还有以下的附加功能：执行防碰撞算法;对电子标签与读卡器之间要传送的数据进行加密和解密;进行电子标签和读卡器之间双向的身份验证。
二、射频信号处理单元电路
读卡器的发射信号功率远大于电子标签反向散射回来的信号，而且与接收信号同频率，这样如果大功率的反射信号漏泄到接收电路就会使接收电路各个部分的器件饱和，导致读卡器对接收信号无法解调，因此射频信号处理模块的技术指标好坏会直接影响到RFID系统的质量水平。射频信号处理模块一般包括两大单元：一是基带信号调制发射模块电路，它由锁相环电路、混频调制电路、滤波电路、功率放大电路等几部分组成;二是射频信号解调接收处理电路，它由差分放大电路，零中频解调电路以及相应的滤波电路构成。
（一）零中频信号接收处理电路
射频信号接收处理电路可以超外差电路和零中频接收电路等等。由于零中频检测接收机具有实现简单，成本低的优点，其技术优势表现在：频率变换关系简单，非线性变换分量更少;可以避免使用中频SAW滤波器;不需要中频放大器，电路结构更简洁，性价比更高。
如前所述，电子标签发射回来的信号的调制为振幅键控调制8197（ASK）方式，并且与阅读器发射信号的载波同频，RFID系统中采用四通道零中频解调电路，来自移相电路中四个检测点的信号均包含阅读器的发射信号和接收到的标签散射回来的信号，它们经过二极管混频处理后，利用低通滤波器将高频成分滤除掉，将分别得到携带标签数据信息和阅读器天线与标签距离（反映在收发信号的相位差上）的信号，其中A、C两点得到的信号在相位上将相差π， B、D的情况也是如此;将它们分别馈入差分放大器D1和D2放大后，得到两路输出信号，它们的振幅反映了标签的数据信息，且相位上相差90°，即它们是正交的。信号再分别经过差分放大器D3和D4进行放大，然后通过比较电路，最终得到TTL电平的IQ信号送入基带电路进行处理。由于I和Q这两路信号是正交的，且只跟阅读器天线和标签之间的距离（根据电磁波的基本知识，其表现为收发信号之间的相位差）有关，这就是说，当标签位于阅读器天线所发射电磁波覆盖的区域内，在每一个确定的时间里，这两路信号不但是唯一确定的，而且更重要的是它们相位的正交保证了这两路信号不可能同时为零，这就确保了电路对电子标签散射信号的有效捕获。