某些硬件只支持特定的开发软件，比如某些嵌入式系统必须使用Linux操作系统和C编程语言。一般来说基于台式机的虚拟仪器系统对开发软件的支持更全面，可以选择Windows或其它操作系统，可以选择LabVIEW、VB 、VC等各种常用编程语言。这其实也是在硬件设计时应当考虑的因素，选择虚拟仪器硬件系统的结构时，应当尽量选择有完善软件支持的硬件设备。
各种开发软件的适用场合、难易程度都不尽相同。选择一种最为广泛应用的开发语言，可以提高软件开发效率，节省开发成本，保证系统质量。
根据TIOBE公司统计的各类编程语言的使用情况，近年来Java、C、C++始终是使用的最为广泛的编程语言。但就测试测量领域来说，情况并非如此。在测控领域，使用最为广泛的编程语言是LabVIEW，它也是开发虚拟仪器系统的首选编程语言。
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