税控器初始化：税控器出厂后投入使用必须对其进行初始化，才能能够进行税务营业。初始化需要将税控卡和用户卡插入税控器中，宿主向税控器发送初始化命令完成。
开票（包括退票和废票）操作：用户卡中购买了发票之后，在开票之前要进行分发发票，然后就可以进行开票操作，税控卡负责对开票数据进行合法性检查，并根据税种税目索引号对开票金额进行分类累计，更新日交易记录，最后生成发票税控码。税控器保存发票明细，更新日累计，宿主打印发票。详细流程如图4.1
报税、完税：将前一阶段税控器所存税控数据写到税控卡和汇总到用户卡内，以供客户（持用户卡）到税务局报税使用。税控管理系统（税务部门）向用户卡发送监控管理数据（下一次报税截止日期、发票限额、累计金额限额、税种税目、明细标志），通过用户卡更新税控器及其税控卡中的监控管理数据。完成完税操作，其中数据申报（报税）流程如图4.2
稽查：当税务机关要想检查税控器内的交易情况时，可以通过税务管理系统发行管理卡来核查税控器的发票明细，日交易数据，申报数据是否和申报带给税务管理系统的数据一致等。
5、应用实例
基于上述设计方案开发的SK-1800税控器已经通过测试和鉴定，符合国家标准，其功能完善，性能可靠、稳定。可设6个税种税目，支持99个收款员使用一台税控器，各有自己的密码，能保存10年日交易数据，循环保存38000 张发票打印数据和1771 卷单卷发票使用汇总数据；能够可靠的完成报税、完税及税务部门的稽查功能。