2002年11月，德国巴伐利亚BadReichenhall市的市医院的婴儿房安装了虹膜识别系统来确保婴儿的安全。这是虹膜识别技术首次应用在婴儿保护方面。这套安全系统只允许婴儿的母亲、护士或者医生进入。一旦婴儿出院，其母亲的虹膜代码数据就被从系统中删除，而不再允许进入。
华盛顿，pennsyvania和阿拉巴马这三个城市的医疗保健体系是基于虹膜识别系统。该系统保证了病人医疗记录不会在未授权的情况下被人看到。HIPPA采用了类似的系统来保证个人信息隐私以及安全。
2004年，位于波士顿的隶属于金普顿酒店集团的NineZero酒店中的CloudNinepenthouse套房和员工通道安装了LGIrisAccess3000虹膜识别仪。
位于曼哈顿的EquinoxFitness俱乐部的体育馆中应用了虹膜识别系统，用于俱乐部的VIP会员进入配备全新设备和最好教练的专用区域。
美国Iriscan研制出的虹膜识别系统已经应用在美国德克萨斯州联合银行的营业部，储户办理银行业务，只要摄像机对用户的眼睛进行扫描就可以对用户的身份进行检验。
由于恐怖袭击的存在，安全防范一直以来都是历届奥运会关注的焦点，虹膜识别技术也以其独有的优点正越来越多地被应用在奥运安防中。例如，在1998年日本长野冬季奥运会中，虹膜识别系统被应用在运动员和政府官员进入奥运村的控制，并使用虹膜识别技术对射击项目的枪支进行安全管理。2004年雅典奥运会中，雅典奥组委启用了包括虹膜识别在内的生物特征识别身份鉴别系统，通过人脸、眼睛、指纹等身体器官及声音、步态、笔迹等肢体行为的全套生物特征识别技术来确认一个人的身份，对所有进出机场、海关、火车站、奥运场馆的人通过摄像机自动识别。
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