首先如果是纯直流电路，滤波电容器的耐压理论上不能低于电路工作电压，也就是12V。按照国标系列，应选择16V耐压的电容器。
如果考虑更多因素的话，最常见的需要考虑的因素应该是可靠性。从可靠性设计角度方面，耐压作为一个重要参数，应该预留足够的余量，以保证在元器件存在小概率参数漂移后，电路仍然可以正常工作。
针对电子产品，目前有现成的标准可以参考。最常见的标准是《GJB/S 35-1993 元器件降额准则》。其中将降额设计划分了3个等级，I级为最高等级，III级为最低等级。目前很多大公司内部民品都遵循II级降额准则。
对于滤波电容，以最常见的铝电解电容为例，应重点考虑：正向电压（包括纹波峰值电压），反向电压，纹波电流和使用寿命。
例如通讯产品中，固定铝电解电容耐压降额参数为70%，因此计算出12V电路，按照此降额原则，电容器应能承受的电压为17.15V，按照标准耐压序列，应选用25V耐压的产品。
其余参数的选择原则，同理。
要考虑到你电路里面电容两端可能出现的最高电压等极限情况，你选择的耐压值至少要比极限值高1.2倍，考虑到实际电容耐压标称值并不是任何电压都有，因此选择标称耐压值还要比计算的电压高，遵循就高不就低的原则。比如12V电路里，如果电路输出是12V，电容耐压最少选16V或者25V的。
12V直流电是平滑直流，还是波峰直流，假如电池，正选波交流电经过整流得到的直流电，或者是有高波峰的交流经过整流的直流电，12V直流电要看波峰电压，有的12V直流电波峰在几千V一般都是电容耐压要超过波峰电压百分之40来选择电容耐压